Muhammad Rafli lahir pada 24 November 1998. Pemain berposisi asli sebagai striker ini juga mampu bermain sebagai gelandang tengah. Rafli adalah didikan dari klub sepakbola Asifa. Ia juga sempat memperkuat Timnas U-19 pada ajang AFF U-19 tahun 2016 lalu.
Selepas memperkuat Timnas U-19, Rafli langsung diganjar kontrak oleh Arema FC. Pada musim 2017 lalu, ia memulai musim pertamanya. Rafli bermain selama 369 menit dalam 7 kali pertandingan. Pada musim 2018, ia masih memperkuat Arema.